Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Actg2-201ENSMUST00000075161 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Surf6-202ENSMUST00000114043 894 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Abhd14a-203ENSMUST00000171925 1122 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Znrd1-202ENSMUST00000172518 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm29539-201ENSMUST00000188031 758 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Med8-201ENSMUST00000019229 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Shisa5-205ENSMUST00000197099 742 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Arhgef33-210ENSMUST00000225548 456 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Them5-201ENSMUST00000029794 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Phyhd1-202ENSMUST00000091132 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm13830-203ENSMUST00000148916 247 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Ccdc6D3YZP9 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm37299-201ENSMUST00000193951 826 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc6D3YZP9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Ccdc6D3YZP9 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Asgr1-205ENSMUST00000146411 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nipsnap3a-204ENSMUST00000188045 1099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 1700063K16Rik-201ENSMUST00000190306 369 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Gm43520-201ENSMUST00000197996 164 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nps-202ENSMUST00000210697 1082 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 4930465M20Rik-201ENSMUST00000130564 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ankrd53-201ENSMUST00000014891 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ccdc6D3YZP9 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms