Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

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Length 519 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pcdh10-203ENSMUST00000171554 7273 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Oprd1-201ENSMUST00000056336 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rcor2-202ENSMUST00000113369 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pou3f4-201ENSMUST00000078229 2928 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Rab31-201ENSMUST00000070673 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Foxred1-202ENSMUST00000127996 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm37472-201ENSMUST00000192342 4052 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Asb8-204ENSMUST00000143400 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Adcyap1r1-201ENSMUST00000070736 3695 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Samd1D3YXK1 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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