Protein–RNA interactions for Protein: C3VPR6

Nlrc5, Protein NLRC5, mousemouse

Predictions only

Length 1,915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc5C3VPR6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm13703-201ENSMUST00000150705 449 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm20721-201ENSMUST00000168292 1484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Apoo-202ENSMUST00000113896 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Gm44980-201ENSMUST00000205826 314 ntBASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Nlrc5C3VPR6 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm16166-201ENSMUST00000118291 787 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Yaf2-201ENSMUST00000080299 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm16853-201ENSMUST00000181812 1986 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm15595-201ENSMUST00000120840 961 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 4931419H13Rik-201ENSMUST00000199770 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Nlrc5C3VPR6 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms