Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm12899-201ENSMUST00000120565 551 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm29676-202ENSMUST00000222409 364 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 A430060F13Rik-201ENSMUST00000124176 378 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm13073-201ENSMUST00000134059 486 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 2310057J18Rik-204ENSMUST00000152363 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rpl31-202ENSMUST00000178079 487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mir7076-201ENSMUST00000183519 74 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ccrl2-203ENSMUST00000199839 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45398-201ENSMUST00000210561 165 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cdc20b-201ENSMUST00000109244 1620 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Eif5a-206ENSMUST00000108609 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Olfr22-ps1-201ENSMUST00000115991 1237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm9022-201ENSMUST00000182482 992 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cd207-201ENSMUST00000037882 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Uba6-202ENSMUST00000113373 3504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Polr3e-202ENSMUST00000106483 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Prss46-201ENSMUST00000119427 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Prss46-202ENSMUST00000176403 1257 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Crhr2-204ENSMUST00000164012 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Gm34045-201ENSMUST00000217700 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc159-202ENSMUST00000170304 1519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cttnbp2B9EJA2 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms