Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm45880-201ENSMUST00000213041 853 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Itk-202ENSMUST00000101306 1185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm37497-201ENSMUST00000195830 798 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rpl10l-201ENSMUST00000081908 1023 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Adamts3-204ENSMUST00000198151 1833 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Gm43273-201ENSMUST00000199649 2594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Brpf1B2RRD7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms