Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dpp8-201ENSMUST00000034960 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ptp4a1-201ENSMUST00000027232 4145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tex26-201ENSMUST00000031667 1137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Plaur-201ENSMUST00000002284 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Cidec-201ENSMUST00000032416 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Mir874-201ENSMUST00000104769 76 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Dera-204ENSMUST00000203216 688 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Spocd1B1ASB6 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms