Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tepsin-202ENSMUST00000093901 2770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm31651-201ENSMUST00000198864 560 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Stx4a-202ENSMUST00000121705 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ndufaf7-201ENSMUST00000024887 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 P2rx4-204ENSMUST00000139631 1030 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Grik3B1AS29 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms