Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Myo18b-201ENSMUST00000086617 8280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Myo5b-203ENSMUST00000121875 6065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Odf2A3KGV1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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