Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Cd1d2-202ENSMUST00000192481 1131 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gadd45a-206ENSMUST00000204282 460 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm46204-201ENSMUST00000219800 411 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC131743.2-201ENSMUST00000221031 968 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm8894-201ENSMUST00000074642 666 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Ivns1abp-201ENSMUST00000023918 3511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm10544-202ENSMUST00000181887 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm5434-202ENSMUST00000222384 1451 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm5434-201ENSMUST00000071825 1451 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm12948-201ENSMUST00000119406 682 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm5621-201ENSMUST00000187303 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm44329-201ENSMUST00000197469 112 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC140375.1-201ENSMUST00000225421 694 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Rpl10-ps3-201ENSMUST00000076364 768 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm45871-202ENSMUST00000209969 1368 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Churc1-203ENSMUST00000126408 462 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm42682-201ENSMUST00000198349 1265 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 AC154184.3-201ENSMUST00000225620 1090 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Il25-201ENSMUST00000037863 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
SetxA2AKX3 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SetxA2AKX3 Rpl36-ps9-201ENSMUST00000196458 277 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.5 ms