Protein–RNA interactions for Protein: A2AJB9

Lcn6, LCN6 isoform alpha, mousemouse

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Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn6A2AJB9 Oaz1-207ENSMUST00000180036 1044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 6330537M06Rik-201ENSMUST00000212384 1642 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Lcn6A2AJB9 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Lcn6A2AJB9 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Lcn6A2AJB9 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Lcn6A2AJB9 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Tspan13-201ENSMUST00000020896 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lcn6A2AJB9 Snhg9-201ENSMUST00000161706 183 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Lcn6A2AJB9 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Vwa8-201ENSMUST00000040990 7054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Lcn6A2AJB9 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms