Protein–RNA interactions for Protein: W4VSP7

Gm3238, MCG61407, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3238W4VSP7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 CT025548.2-201ENSMUST00000226227 1329 ntBASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mir669p-2-201ENSMUST00000103868 87 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mir669p-1-201ENSMUST00000103884 87 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Nbdy-201ENSMUST00000140575 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm27175-201ENSMUST00000183759 606 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm27223-201ENSMUST00000184653 606 ntTSL 3 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm5066-201ENSMUST00000188479 822 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm2622-201ENSMUST00000200018 471 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm19269-201ENSMUST00000211401 804 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm18996-201ENSMUST00000214851 755 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mpzl2-205ENSMUST00000217097 1175 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Psma1-201ENSMUST00000033008 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Olfr434-201ENSMUST00000076752 1056 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zfp865-202ENSMUST00000076791 1129 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm20756-201ENSMUST00000201080 1595 ntTSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC10.04□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Nppb-201ENSMUST00000103231 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Csn1s2b-203ENSMUST00000113279 745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Sva-202ENSMUST00000117406 645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Csnk2a1-ps-201ENSMUST00000118846 1175 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm12788-201ENSMUST00000119090 308 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm11407-201ENSMUST00000120362 1058 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Gm14054-201ENSMUST00000120744 704 ntBASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Gm3238W4VSP7 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
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