Protein–RNA interactions for Protein: V9GX34

Csmd2, CUB and Sushi multiple domains 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,611 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd2V9GX34 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm11836-201ENSMUST00000121022 441 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm45120-201ENSMUST00000208880 408 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tsen2-201ENSMUST00000040234 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tardbp-204ENSMUST00000105699 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13832-202ENSMUST00000151159 370 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Stt3a-209ENSMUST00000217599 285 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Prss47-202ENSMUST00000203968 1353 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Smim11-202ENSMUST00000118064 782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13267-201ENSMUST00000142787 698 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Zbtb42-203ENSMUST00000174780 3160 ntTSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13205-201ENSMUST00000123548 562 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm6652-201ENSMUST00000186414 1070 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm3332-201ENSMUST00000189337 928 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm7596-202ENSMUST00000202171 737 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Agbl3-201ENSMUST00000115009 806 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cmtm2b-201ENSMUST00000041973 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cox17-201ENSMUST00000050273 444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Olfr354-201ENSMUST00000068475 1084 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Tssk4-201ENSMUST00000007735 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm13965-201ENSMUST00000154834 576 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Car14-201ENSMUST00000036181 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Csmd2V9GX34 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms