Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L2

Syngr4, Synaptogyrin-4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr4Q9Z1L2 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Rpe-201ENSMUST00000027157 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Crtc1-201ENSMUST00000076615 5683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ociad1-201ENSMUST00000031038 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC11.33□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Trpm7-202ENSMUST00000103224 7107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.59
Syngr4Q9Z1L2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Nol4l-202ENSMUST00000109784 5610 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Dnmbp-205ENSMUST00000212396 6100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ankrd42-202ENSMUST00000118157 2782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hectd2-208ENSMUST00000169036 3842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC11.33□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Phrf1-202ENSMUST00000122143 4864 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Syngr4Q9Z1L2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms