Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0I7

Slfn1, Schlafen 1, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn1Q9Z0I7 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Cdc26-202ENSMUST00000107459 654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 C130026I21Rik-205ENSMUST00000161267 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm37201-201ENSMUST00000191845 523 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 1700112L15Rik-201ENSMUST00000212067 510 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tax1bp3-202ENSMUST00000108477 1153 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Has2os-201ENSMUST00000125401 485 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 AC110816.2-201ENSMUST00000220360 1323 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm14597-202ENSMUST00000129769 715 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Calml4-207ENSMUST00000215968 526 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 AC123665.1-201ENSMUST00000228204 438 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Sass6-206ENSMUST00000198386 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Slfn1Q9Z0I7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.7 ms