Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0H8

Clip2, CAP-Gly domain-containing linker protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip2Q9Z0H8 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr707-201ENSMUST00000088687 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr1532-ps1-201ENSMUST00000098140 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clip2Q9Z0H8 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 2310026I22Rik-201ENSMUST00000180941 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm18054-201ENSMUST00000207539 555 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Jph2-201ENSMUST00000017961 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm45332-201ENSMUST00000210508 1949 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Cpa1-201ENSMUST00000031806 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Clip2Q9Z0H8 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms