Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1B9

Slit2, Slit homolog 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit2Q9R1B9 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Mir181d-201ENSMUST00000102383 72 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm28071-201ENSMUST00000190355 478 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm45184-201ENSMUST00000206354 955 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Lst1-201ENSMUST00000097336 415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gdf9-201ENSMUST00000018382 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Gm32352-201ENSMUST00000212465 688 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 AC166341.2-201ENSMUST00000220571 120 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Scg5-201ENSMUST00000024005 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Actg1-201ENSMUST00000062147 876 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Slc25a5-ps-202ENSMUST00000223716 1786 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Slit2Q9R1B9 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm4879-201ENSMUST00000122190 1272 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Ino80dos-202ENSMUST00000186436 652 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Hspb11-201ENSMUST00000046558 608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Spink2-201ENSMUST00000065216 631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Sertm1-202ENSMUST00000162201 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Slit2Q9R1B9 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms