Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZL0

Ripk3, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 3, mousemouse

Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk3Q9QZL0 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm37229-201ENSMUST00000191643 732 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm3898-202ENSMUST00000216905 328 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Pebp4-201ENSMUST00000022678 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Prrxl1-205ENSMUST00000228878 723 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Rpl3l-201ENSMUST00000045186 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Rps15-202ENSMUST00000068408 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Pmp22-202ENSMUST00000108700 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gstp1-201ENSMUST00000169613 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 CT485607.1-201ENSMUST00000216100 85 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf19-203ENSMUST00000224371 1239 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tff1-201ENSMUST00000024831 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm10785-201ENSMUST00000156242 1583 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ttc4-202ENSMUST00000106772 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm34023-201ENSMUST00000195539 217 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm11634-202ENSMUST00000209862 573 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm22058-201ENSMUST00000083393 310 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Dpm2-203ENSMUST00000140592 1412 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Ripk3Q9QZL0 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms