Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Mir7221-201ENSMUST00000184009 72 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 AC110091.3-202ENSMUST00000217104 791 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Limd1Q9QXD8 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Phactr2-201ENSMUST00000079698 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nmral1-202ENSMUST00000079130 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Olfr1234-202ENSMUST00000111543 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm11222-201ENSMUST00000119005 738 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm829-202ENSMUST00000146622 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ccdc163-201ENSMUST00000030452 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cd59a-201ENSMUST00000040423 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 2210406O10Rik-202ENSMUST00000122882 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Limd1Q9QXD8 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms