Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMD1

Sfmbt1, Scm-like with four MBT domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfmbt1Q9JMD1 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Npepps-215ENSMUST00000167806 2307 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Txn2-202ENSMUST00000100486 676 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Borcs5-202ENSMUST00000166591 792 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm32926-201ENSMUST00000214043 681 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 9930014A18Rik-201ENSMUST00000180730 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm3693-201ENSMUST00000182077 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nfatc4-201ENSMUST00000024179 3267 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fmo1-202ENSMUST00000111518 1506 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Ambp-201ENSMUST00000030041 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Sfmbt1Q9JMD1 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms