Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Zfp536-203ENSMUST00000176114 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Mapt-204ENSMUST00000106992 5253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Corin-201ENSMUST00000005352 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-203ENSMUST00000101581 3879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-206ENSMUST00000180204 3882 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ddah1-201ENSMUST00000029845 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Scyl2-201ENSMUST00000092227 3566 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fam214b-203ENSMUST00000107957 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Incenp-201ENSMUST00000025562 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Pcdhga11-201ENSMUST00000061279 4756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Fam234b-202ENSMUST00000111916 2927 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rabgef1Q9JM13 Prodh-205ENSMUST00000136776 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
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