Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Unc45bos-201ENSMUST00000156395 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Mir671-201ENSMUST00000102432 98 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Uqcc1-202ENSMUST00000109631 1091 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm14718-201ENSMUST00000138082 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm12766-201ENSMUST00000140298 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm10135-201ENSMUST00000043711 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Rab13-201ENSMUST00000065418 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Dclk1Q9JLM8 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 2610301B20Rik-202ENSMUST00000101504 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Gm14274-201ENSMUST00000117182 615 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Gm13549-201ENSMUST00000118339 796 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 AC034099.1-202ENSMUST00000133843 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Aimp1-201ENSMUST00000029663 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Dclk1Q9JLM8 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms