Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm7535-201ENSMUST00000164167 909 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 3110080O07Rik-201ENSMUST00000193469 1021 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Cox5a-201ENSMUST00000000090 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 Lrrfip2-213ENSMUST00000216430 1525 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Col5a3Q9JLI2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44401-201ENSMUST00000204462 2375 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Styxl1-208ENSMUST00000178515 1651 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm11628-201ENSMUST00000117568 171 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm20537-202ENSMUST00000173131 889 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 5830428M24Rik-204ENSMUST00000223143 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Sstr2-201ENSMUST00000067591 1041 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Dusp14-201ENSMUST00000018792 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Col5a3Q9JLI2 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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