Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF6

Tgm1, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase K, mousemouse

Predictions only

Length 815 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm1Q9JLF6 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Lmna-201ENSMUST00000029699 3156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm42706-201ENSMUST00000199733 1910 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Nrd1-202ENSMUST00000102736 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
Tgm1Q9JLF6 Psen1-201ENSMUST00000041806 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
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Tgm1Q9JLF6 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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Tgm1Q9JLF6 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Leng8-203ENSMUST00000121270 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tgm1Q9JLF6 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
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