Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB9

Nectin3, Nectin-3, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin3Q9JLB9 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Tmem230-203ENSMUST00000110164 2957 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ifnar2-201ENSMUST00000023693 3047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Eif4g3-204ENSMUST00000105830 3252 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Gprasp1-201ENSMUST00000113144 5843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Nectin3Q9JLB9 Arhgef2-219ENSMUST00000176500 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Ocln-203ENSMUST00000159459 1950 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Nectin3Q9JLB9 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.8 ms