Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL96

Ctsm, Cathepsin M, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsmQ9JL96 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Atg7-207ENSMUST00000182428 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Cxcr5-204ENSMUST00000215293 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Clcn6-201ENSMUST00000030879 3306 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Zc3h18-201ENSMUST00000017622 3810 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Hadhb-202ENSMUST00000114783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
CtsmQ9JL96 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Emp1-206ENSMUST00000205156 2911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Adam33-202ENSMUST00000110232 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
CtsmQ9JL96 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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