Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJZ2

Tuba8, Tubulin alpha-8 chain, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tuba8Q9JJZ2 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tmcc2-206ENSMUST00000142609 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 AC151895.1-201ENSMUST00000219025 1742 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Grip1-212ENSMUST00000147356 4145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ctps2-206ENSMUST00000112303 3289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Alpi-201ENSMUST00000113270 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm44851-201ENSMUST00000205735 2309 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 C1qtnf6-201ENSMUST00000023075 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Plod3-201ENSMUST00000004968 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Uqcr10-201ENSMUST00000058407 434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ccng1-201ENSMUST00000020576 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Dysf-213ENSMUST00000203803 6590 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Klk2-ps-202ENSMUST00000206865 2684 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 Hdc-201ENSMUST00000028838 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Tuba8Q9JJZ2 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms