Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tas2r126-201ENSMUST00000059534 930 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpn-201ENSMUST00000059305 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Adh4-201ENSMUST00000013458 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap10-10-201ENSMUST00000218843 1306 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Tcea1-201ENSMUST00000081551 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Vps29-208ENSMUST00000155671 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Pisd-ps2-201ENSMUST00000127960 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm14460-201ENSMUST00000121511 639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Lnx1-209ENSMUST00000153543 2208 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
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Rb1cc1Q9ESK9 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12298-201ENSMUST00000126999 731 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 1110038B12Rik-208ENSMUST00000174714 520 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Rb1cc1Q9ESK9 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 B230119M05Rik-201ENSMUST00000154072 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sox2ot-217ENSMUST00000200414 710 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Prm3-201ENSMUST00000050864 410 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rb1cc1Q9ESK9 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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