Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP64

Tnmd, Tenomodulin, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnmdQ9EP64 Spryd7-201ENSMUST00000022497 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Plekhg2-202ENSMUST00000119990 4880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 B230217C12Rik-202ENSMUST00000155954 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gcom1-201ENSMUST00000163998 1726 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Dus2-201ENSMUST00000034375 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Pgr-204ENSMUST00000189181 6889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Irf8-201ENSMUST00000047737 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 9130019O22Rik-202ENSMUST00000164345 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cd63-202ENSMUST00000105229 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cd63-204ENSMUST00000219317 1109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Gm21982-201ENSMUST00000146232 3821 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
TnmdQ9EP64 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms