Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Clcn3-204ENSMUST00000110301 4099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 2810039B14Rik-206ENSMUST00000185040 1113 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 5330425B07Rik-201ENSMUST00000196714 1027 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ppil2-212ENSMUST00000164458 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Akr1b3-201ENSMUST00000102980 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Thpo-201ENSMUST00000076422 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm17420-201ENSMUST00000164753 153 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm23363-201ENSMUST00000175024 79 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Plin1-203ENSMUST00000205413 1294 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Plch2-207ENSMUST00000139976 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Bcs1l-203ENSMUST00000113733 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Arid4b-202ENSMUST00000110533 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Ndufa2-201ENSMUST00000014438 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm14209-201ENSMUST00000154946 462 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Csnk1dQ9DC28 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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