Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Trmt1l-201ENSMUST00000065625 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp819-203ENSMUST00000120935 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pkm-202ENSMUST00000163694 2041 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tgm1-201ENSMUST00000002389 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Hspa4l-201ENSMUST00000108086 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Zp1-201ENSMUST00000025641 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-205ENSMUST00000113324 2121 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-207ENSMUST00000113328 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Rgs20-202ENSMUST00000118000 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Foxp1-228ENSMUST00000177307 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tmc8-204ENSMUST00000119455 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cyp27a1Q9DBG1 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms