Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Dag1-204ENSMUST00000191899 5662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Acin1-202ENSMUST00000022794 2365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm13134-202ENSMUST00000144347 387 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Taok2-202ENSMUST00000117394 4985 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Copb2-201ENSMUST00000035033 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm10863-205ENSMUST00000148028 905 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Mul1-202ENSMUST00000105813 3944 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Ddx19b-202ENSMUST00000065784 3104 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Mansc1-201ENSMUST00000047443 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Med27Q9DB40 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms