Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 3830422I06Rik-201ENSMUST00000200199 1181 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Chmp2aQ9DB34 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC13.65□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Kcnab2-203ENSMUST00000159186 1552 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 CT573086.1-201ENSMUST00000227202 1074 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Prss36-202ENSMUST00000118755 3028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Lgals12-203ENSMUST00000159983 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 1700127F24Rik-201ENSMUST00000221685 604 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Chmp2aQ9DB34 Baiap2l1-201ENSMUST00000055190 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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