Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm43417-201ENSMUST00000201586 5207 ntBASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 B4galnt3-203ENSMUST00000212457 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dennd2d-201ENSMUST00000029508 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Sec23b-201ENSMUST00000028916 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Nxf1-211ENSMUST00000184970 5591 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Syne3-203ENSMUST00000109927 5263 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Bbof1-201ENSMUST00000081828 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Shisa3-201ENSMUST00000087241 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Gm45266-201ENSMUST00000210111 2173 ntBASIC12.52□□□□□ -0.4
Pop5Q9DB28 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tfe3-206ENSMUST00000115679 3239 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ighv8-10-201ENSMUST00000199579 358 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 Ficd-201ENSMUST00000065698 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.51□□□□□ -0.41
Pop5Q9DB28 AC154527.2-201ENSMUST00000225256 1466 ntBASIC12.51□□□□□ -0.41
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