Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

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Length 206 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ift43Q9DA69 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Ift43Q9DA69 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Ift43Q9DA69 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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Ift43Q9DA69 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Ift43Q9DA69 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms