Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M4

Pdzd9, PDZ domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd9Q9D9M4 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 4930444K16Rik-201ENSMUST00000220438 1767 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm16168-201ENSMUST00000161091 1359 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mymx-201ENSMUST00000113529 442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm12217-201ENSMUST00000118858 696 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm14277-201ENSMUST00000121195 360 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm33175-201ENSMUST00000211562 461 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 AC125206.1-201ENSMUST00000214070 739 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Wdr45-223ENSMUST00000207675 1335 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pdlim5-208ENSMUST00000196220 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Ins2-203ENSMUST00000105931 472 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pom121l12-201ENSMUST00000117584 1039 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Naa60-207ENSMUST00000150655 1166 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Arf4os-201ENSMUST00000166902 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Anapc16-202ENSMUST00000182116 581 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mir6979-201ENSMUST00000183927 56 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Pdzd9Q9D9M4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kbtbd6-201ENSMUST00000100359 2982 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pdzd9Q9D9M4 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 4933421D24Rik-201ENSMUST00000209302 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Olfr524-201ENSMUST00000051943 1058 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 AC126444.1-201ENSMUST00000225938 1768 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 6430550D23Rik-201ENSMUST00000086145 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Brsk1-202ENSMUST00000120836 2867 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pdzd9Q9D9M4 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms