Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cox4i2-201ENSMUST00000010020 727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 5830418P13Rik-201ENSMUST00000143564 2178 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
Alkbh4Q9D8F1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 Spc24-204ENSMUST00000216057 627 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
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Alkbh4Q9D8F1 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 C030047K22Rik-201ENSMUST00000150382 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Alkbh4Q9D8F1 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms