Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8D0

Tnfrsf13c, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 13C, mousemouse

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Length 175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf13cQ9D8D0 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc38a10-216ENSMUST00000179094 4052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Etaa1-201ENSMUST00000076661 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm42839-201ENSMUST00000198978 525 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sun2-201ENSMUST00000046259 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdhgb6-201ENSMUST00000003599 4684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pnpla6-202ENSMUST00000111070 4496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a16-201ENSMUST00000019978 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lrrc74b-201ENSMUST00000023442 2135 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Rgs12-207ENSMUST00000114285 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5936-201ENSMUST00000114116 2857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm5640-201ENSMUST00000114119 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 DXBay18-201ENSMUST00000080324 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14685-201ENSMUST00000088459 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Sv2a-201ENSMUST00000035371 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Syvn1-204ENSMUST00000138532 3464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lgr5-201ENSMUST00000020350 4714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcnt-202ENSMUST00000217838 9341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pitpnm2-201ENSMUST00000086123 6620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gba-202ENSMUST00000167998 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc22a5-201ENSMUST00000019044 3062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Ucp3-201ENSMUST00000032958 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Acacb-201ENSMUST00000031583 8482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Wdr4-207ENSMUST00000171171 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Cd33-202ENSMUST00000039861 1791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Dnm2-201ENSMUST00000072362 3502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Tnfrsf13cQ9D8D0 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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