Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Zfp541-202ENSMUST00000209369 4879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Cyp2c55Q9D816 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 4931406C07Rik-208ENSMUST00000216955 1750 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Siglecg-201ENSMUST00000005592 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm12539-201ENSMUST00000121549 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 1110006O24Rik-201ENSMUST00000201728 768 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm4782-201ENSMUST00000168705 2046 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pde9a-203ENSMUST00000127929 1891 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Lrguk-202ENSMUST00000101564 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm28693-202ENSMUST00000190758 331 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Cyp2c55Q9D816 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.5 ms