Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7Y9

Slx4ip, Protein SLX4IP, mousemouse

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slx4ipQ9D7Y9 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Magi1-206ENSMUST00000203688 4969 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ubqln5-201ENSMUST00000053743 1915 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Naa50-201ENSMUST00000063520 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cbfa2t2-ps1-201ENSMUST00000117165 730 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Bcat2-203ENSMUST00000209204 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8617-201ENSMUST00000118796 2222 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Kpna7-203ENSMUST00000116454 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Slx4ipQ9D7Y9 Pla2g6-201ENSMUST00000047816 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx4ipQ9D7Y9 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Slx4ipQ9D7Y9 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms