Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ano6-208ENSMUST00000227791 3149 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rnf17-202ENSMUST00000223627 2077 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Mcpt9-201ENSMUST00000095798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Olfr157-202ENSMUST00000215442 1766 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 9330198N18Rik-201ENSMUST00000146702 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sugp2-201ENSMUST00000093458 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Cldn22Q9D7U6 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Phf21a-206ENSMUST00000111292 2461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 AC073947.2-201ENSMUST00000215888 1130 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Slc25a42-201ENSMUST00000063788 3081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dnpep-209ENSMUST00000187836 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Cldn22Q9D7U6 AC122459.1-201ENSMUST00000228373 885 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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