Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Fam217b-201ENSMUST00000094251 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zrsr2-201ENSMUST00000090840 3867 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cyb5rl-201ENSMUST00000030364 2360 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 A930007I19Rik-203ENSMUST00000181726 2099 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Jrk-201ENSMUST00000050234 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Ttbk2-202ENSMUST00000057135 11066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Nrros-208ENSMUST00000143682 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ccr7-201ENSMUST00000103134 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Rdh19-201ENSMUST00000077530 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Klhl26-201ENSMUST00000066597 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Irf6-201ENSMUST00000076521 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
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Nop56Q9D6Z1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Hltf-201ENSMUST00000002502 4955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Wdr59-201ENSMUST00000034437 4896 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Calu-206ENSMUST00000172974 3063 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 H2-T22-202ENSMUST00000077960 1694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Nop56Q9D6Z1 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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