Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Mcph1-201ENSMUST00000039412 4662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfp862-ps-201ENSMUST00000203457 3282 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Plekhd1os-201ENSMUST00000153297 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Abhd18-202ENSMUST00000108078 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Slc6a16-201ENSMUST00000179310 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rbm11-203ENSMUST00000114253 2699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm8798-201ENSMUST00000211877 1661 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfp12-203ENSMUST00000077485 4294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Comt-204ENSMUST00000165430 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ptgr2-205ENSMUST00000135001 1286 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Triml2-203ENSMUST00000209872 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Acin1-208ENSMUST00000126166 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Igf2-204ENSMUST00000105936 3970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vash2-201ENSMUST00000047409 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Vsx2-202ENSMUST00000169934 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 AC123834.1-201ENSMUST00000225346 2043 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 3830432H09Rik-202ENSMUST00000188909 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Qrich1-202ENSMUST00000112155 3040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Klhl14-201ENSMUST00000049105 4018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Zeb2-202ENSMUST00000068415 5624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Gm26770-201ENSMUST00000180586 2237 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Ccdc94Q9D6J3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms