Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H2

Gcc1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 778 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcc1Q9D4H2 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fbxw17-201ENSMUST00000046974 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Afap1l1-201ENSMUST00000120472 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm38161-201ENSMUST00000195344 576 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Mrps22-201ENSMUST00000035034 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Tctn2-207ENSMUST00000185820 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gcc1Q9D4H2 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 M6pr-201ENSMUST00000007602 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Hspa4-201ENSMUST00000020630 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Asic3-202ENSMUST00000196296 1593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-230ENSMUST00000201205 2270 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cdk10-212ENSMUST00000213005 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Tufm-202ENSMUST00000106392 1754 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Tcf4-210ENSMUST00000128706 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Prr13-204ENSMUST00000164957 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Fetub-201ENSMUST00000023587 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Fam222b-201ENSMUST00000073705 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Mapkapk5-205ENSMUST00000111786 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Gm20521-201ENSMUST00000134077 1245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gcc1Q9D4H2 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms