Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc16a2-201ENSMUST00000042664 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cyp2b10-201ENSMUST00000005477 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm43045-201ENSMUST00000198725 2095 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc25a25-205ENSMUST00000113310 3278 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 BC051019-201ENSMUST00000033334 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fam13c-202ENSMUST00000105436 3380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gadl1-203ENSMUST00000121770 1763 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Oaz2-ps-201ENSMUST00000121735 537 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cpq-207ENSMUST00000228916 1842 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Rpl29-201ENSMUST00000059802 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Gm15544-201ENSMUST00000118776 1531 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rufy3Q9D394 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms