Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Dctn2-201ENSMUST00000026479 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tubb2a-201ENSMUST00000056427 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Qdpr-202ENSMUST00000117425 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pla2g10os-201ENSMUST00000141172 174 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Majin-201ENSMUST00000025699 1239 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rnps1-201ENSMUST00000088512 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm2824-203ENSMUST00000226189 1228 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Snrnp35Q9D384 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Th-201ENSMUST00000000219 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm9061-201ENSMUST00000182707 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 Psmc3-203ENSMUST00000111441 1419 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Snrnp35Q9D384 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.7 ms