Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Khdrbs2-205ENSMUST00000189878 3259 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Stard5-202ENSMUST00000117410 2832 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Prkcd-202ENSMUST00000112202 2005 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Rnf44-218ENSMUST00000177950 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Pced1b-201ENSMUST00000059433 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gnb2-202ENSMUST00000111020 1470 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Mest-211ENSMUST00000163949 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Brms1-201ENSMUST00000116567 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Tgm1-202ENSMUST00000168729 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Prok2-203ENSMUST00000101120 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
Snx20Q9D2Y5 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cebpd-201ENSMUST00000096232 3746 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Lrrc20-201ENSMUST00000049242 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rnf4-201ENSMUST00000030992 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Dmrtc1c2-201ENSMUST00000087896 1255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Rpl9-204ENSMUST00000127874 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Gjb5-201ENSMUST00000046498 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Kcnn1-204ENSMUST00000212086 2964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Snx20Q9D2Y5 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms