Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gpr158-201ENSMUST00000055946 7171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Lypd6-202ENSMUST00000112712 3495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Asap1-201ENSMUST00000023008 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Togaram1-207ENSMUST00000223166 6386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Xkr8-201ENSMUST00000045550 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Adcyap1r1-206ENSMUST00000167234 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Met-202ENSMUST00000115442 4663 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tnc-201ENSMUST00000030056 6833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 AC122228.1-201ENSMUST00000223113 2057 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Ank3-201ENSMUST00000047061 2517 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Wnt9a-202ENSMUST00000108783 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Abcg8-203ENSMUST00000171915 2284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Mrpl28Q9D1B9 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms