Protein–RNA interactions for Protein: Q9D114

Hddc3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc3Q9D114 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ate1-204ENSMUST00000178534 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp82-201ENSMUST00000080834 2181 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Crx-203ENSMUST00000172758 1469 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tulp2-201ENSMUST00000024233 1749 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ighv2-9-201ENSMUST00000103451 362 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Isg20-204ENSMUST00000121645 1087 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AC135669.1-202ENSMUST00000216742 540 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ppp6r1-201ENSMUST00000064099 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 AC122371.1-201ENSMUST00000220876 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sv2c-203ENSMUST00000182289 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 4933431E20Rik-209ENSMUST00000146337 1636 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Ict1os-201ENSMUST00000125653 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hddc3Q9D114 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.3 ms