Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0F6

Rfc5, Replication factor C subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc5Q9D0F6 Alkbh3-202ENSMUST00000111240 1395 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sirt4-201ENSMUST00000112066 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mettl17-206ENSMUST00000164902 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Erlin1-206ENSMUST00000170801 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm10478-201ENSMUST00000084451 396 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ptgir-201ENSMUST00000086101 2725 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Usp17le-201ENSMUST00000053464 1626 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Adat1-203ENSMUST00000139820 2762 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Msra-205ENSMUST00000210428 1180 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 A430005L14Rik-201ENSMUST00000058393 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Gm37648-201ENSMUST00000192072 2563 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Rfc5Q9D0F6 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms