Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tbc1d8-204ENSMUST00000193823 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Calr3-201ENSMUST00000019876 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Accsl-201ENSMUST00000099690 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Brd4-201ENSMUST00000003726 5955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Mis12Q9CY25 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Bahcc1-202ENSMUST00000118987 10712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm40377-201ENSMUST00000204604 2015 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Olfr1428-203ENSMUST00000214103 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm5161-201ENSMUST00000075243 853 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Mis12Q9CY25 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms